Javier Fernández Ruiz est titulaire d'un doctorat en biologie (1986) de l'Université Complutense de Madrid (UCM). Il est actuellement professeur à la faculté de médecine de l'UCM. Il se consacre à la recherche depuis 42 ans. Il est l'auteur de nombreux articles de recherche et de synthèse, de chapitres de livres et de brevets, et intervient dans des universités, des centres de recherche et des conférences. Il est actuellement le chercheur principal du groupe de recherche CANNABINOIDES-BBM3 de l'Institut universitaire de recherche en neurochimie de l'UCM, CIBERNED et IRYCIS. L'activité principale de ce groupe se concentre sur l'étude du potentiel thérapeutique des cannabinoïdes dans plusieurs maladies neurodégénératives, activité dans laquelle il collabore avec plusieurs groupes nationaux et internationaux, ainsi qu'avec différentes sociétés pharmaceutiques. En tant que chercheur principal, il a dirigé plusieurs projets de recherche nationaux et internationaux. Il a été président de la Société internationale de recherche sur les cannabinoïdes (ICRS) (2002-2003), ainsi que membre fondateur de la Société espagnole de recherche sur les cannabinoïdes (SEIC), où il a occupé les postes de secrétaire (2000-2007) et de président (2007-2011). Il est actuellement membre du comité de rédaction du British Journal of Pharmacology. Il a reçu plusieurs prix ces dernières années pour son activité scientifique, notamment le « Special Award » de l'International Association for Cannabinoids as Medicines (IACM) en 2019 et le « Mechoulam Award » de l'ICRS en 2021.